Mga Gamer Naglalaro ng 'EteRNA' Lang Puksain ang Propesyonal na Agham sa Mahalagang Pagtuklas na Ito

Ang agham ng mamamayan ay nagpunta lamang sa susunod na antas: Ang mga manlalaro ng video ay gumawa ng biological discovery, at ngayon ay na-publish na ng isang peer-reviewed journal na pang-agham.

Nai-publish na ito linggo sa Journal of Molecular Biology, isang serye ng mga intuitive na binuo panuntunan para sa kung paano mahirap isang partikular na hugis ay upang makamit sa pamamagitan ng RNA disenyo. Halimbawa, nakita nila na ang mas simetriko ang isang hugis ay, mas mahirap itong mag-disenyo ng isang piraso ng RNA upang tumugma ito.

Ang kolektibo ng mga manlalaro ng video ay ginawa ang pagtuklas sa pamamagitan ng paglalaro, EteRNA, isang laro na hinahamon ang mga manlalaro na kumuha ng mga strands ng RNA at tiklupin ang mga ito sa isang nais na hugis sa pamamagitan ng pagbabago ng kanilang kemikal na pampaganda. Ang pang-agham na suliranin ng natitiklop na RNA sa isang partikular na hugis ay kumplikado, ngunit ang laro ay hindi - walang pag-unawa sa biochemistry ay kinakailangan upang simulan ang paglalaro.

Kinuha ng mga manlalaro ang pananaliksik na tanong sa kanilang sariling inisyatiba, bilang isang paraan ng pagbibigay ng mga bagong tool ng manlalaro upang hatulan ang kamag-anak na kahirapan ng iba't ibang mga puzzle. Ang mga natuklasan ay makakatulong sa gabay sa biomedical na pananaliksik sa hinaharap, dahil ang bagong hanay ng mga alituntunin ay nagbibigay sa mga siyentipiko ng isang mas mahusay na kahulugan ng kung o hindi sinusubukan na tiklop RNA sa isang ibinigay na hugis ay isang walang saysay na ehersisyo.

"Ang pananaliksik na ito ay nagpapahiwatig na ang standard na paradaym ng siyentipikong crowdsourcing ay maaaring binaligtad," sabi ni Rhiju Das, isang propesor ng biochemistry sa Stanford,. Kabaligtaran sa isang email. EteRNA ay inilunsad noong 2011 ni Das at Adrien Treuille, isang assistant professor ng computer science sa Carnegie Mellon University. " EteRNA ang mga manlalaro ay maaaring mag-isip ng kanilang sariling mga katanungan sa pananaliksik at maaaring isulat ang kanilang sariling mga papeles. Sa pananaliksik na ito, mayroong isang maliit na patnubay at independiyenteng pagsusuri mula sa mga eksperto sa aking lab."

Ang Synthesized RNA ay mayroong isang napakalaking potensyal para sa isang bagong henerasyon ng mga gamot at mga medikal na therapies. Kung maaari itong nakatiklop sa tamang hugis, maaaring itayo ang RNA upang ma-target ang mga tiyak na mga virus, kanser, at kahit na mga genetic disorder. Ang CRISPR, isang proseso ng pag-edit ng gene na maaaring baguhin ang hinaharap ng pagkakaroon ng tao, ay gumagamit ng RNA upang gabayan ang enzyme ng DNA-cutting, Cas9, sa hindi kanais-nais na seksyon ng DNA.

EteRNA nagsimula bilang isang forum para sa mga dalubhasang siyentipiko upang ipakita ang mga puzzle sa mga manlalaro, ngunit ito ay lumago na lampas na. Ang laro at ang 100,000 rehistradong manlalaro ay umiiral na ngayon sa isang simbiyotiko at nagbabagong kaugnayan sa mga propesyonal na siyentipiko at mga modelo ng computer na binuo upang mag-disenyo at subukan ang istraktura ng RNA.

"Computer pagmomolde at EteRNA ay hindi eksklusibo, "sabi ni Das. " EteRNA pinagsasama-sama ng maraming mga tao, ang ilan sa kanila ay nagsusulat ng kanilang sariling mga modelong computer."

Sa kasalukuyang papel, ang mga manlalaro ay magkakasamang nagsulat ng mga script upang subukan ang kanilang mga ideya para sa kung bakit ang mga istraktura ng RNA ay mahirap na magdisenyo. Sinabi ni Das na sinabi sa ilang manlalaro na lalo silang nagaganyak na i-automate ang kanilang mga ideya sa mga modelo ng computer dahil gusto nilang magpatuloy at malutas ang mas mahirap na mga problema.

Mga problema na itinayo ng EteRNA ang mga manlalaro ay aktwal na na-synthesized sa Das 'lab - sa ngayon 86,459 player na binuo sequences ay binuo IRL.

Ang mga nangunguna na may-akda ng papel ay EteRNA ang mga manlalaro Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju, at Michelle Wu. Si Wu ay isang Ph.D. estudyante sa biomedical informatics sa Stanford.

Sa hinaharap, maaaring ang mga eksperto ng mamamayan ay magsimulang mag-publish ng mga natuklasang pang-agham na ganap na nakapag-iisa.

"Ang template na ito na 'flipped crowdsourcing' para sa civilian science ay maaaring maging kapaki-pakinabang para sa iba pang mga proyekto at larangan ng agham, tulad ng astronomiya (Galaxy Zoo) o pagkakakilanlan ng karamihan ng tao-pinagkunan (Barcode of Life), "Sabi ni Das. "Lalo na kung sila, gusto EteRNA, ay nakakakita ng mga bottleneck sa yugtong pagsulat ng papel."