Sequencing the Black Rhino Genome Maaaring I-save ang Species Mula sa pagkalipol

$config[ads_kvadrat] not found

The race to save Black Rhinos | Hotspots

The race to save Black Rhinos | Hotspots
Anonim

Ang ika-21 siglo ay isang hindi kapani-paniwala oras upang maging isang bioengineer at isang kakila-kilabot na oras upang maging isang itim na rhinoceros. Ang Aprikanong uri ng hayop, na may bilang na 850,000 isang siglo na ang nakalilipas ay naging mabilis na lumiliit na populasyon sa paligid ng 5,000. Sa pag-asa ng isang araw na muling pag-ulit ng malubhang pagtanggi na ito, pinagsisikapan ng mga biologist na madiskubre ang pagkakasunud-sunod ng diceros bicornis bicornis genome.

Ang proyektong ito ay isang pakikipagtulungan sa pagitan ng maraming eksperto sa biotech na konserbasyon, kabilang ang Pathologist ng University of Washington at bioengineer na si Dr. Charles Murray at si Matthew Markus, ang CEO ng Pembient. Ang Pembient ay isang kumpanya ng Biotechnology ng San Francisco na gustong bahain ang mga Intsik na may sintetiko - ngunit biologically identical - rhino horn, 3D na naka-print mula sa lab na ginawa keratin at marahil naihatid bilang rhino beer. (Keratin ang mga bagay-bagay na ang iyong mga kuko at rhino horns ay gawa sa. Ito ay hindi kaakit-akit o nakapagpapagaling.) Ang tagapagturo ay maaaring matuto nang sapat mula sa genome ng isang rhino na may pangalang Ntombi, sinabi ni Markus Kabaligtaran, upang pinuhin ang paraan ng pagsasagisag nito ng mga protina ng rhino.

Ngunit bago ang sinuman ay maaaring mamanahin ang genetika ng Ntombi para sa datos, ang unang itim na rhino genome ay dapat na susundan muna. Ang proyekto ay tungkol sa kalahati sa pagpapalaki ng $ 16,500 sa Experiment.com, isang crowdfunding na uri ng platform tulad ng Kickstarter maliban sa agham sa halip na muling pagbubuhay ng mga long-dead video games.

"May mga medyo ilang mga organismo na ang mga genome ay na-sequenced," sabi ni Murray. "Hanggang sa kamakailan-lamang na ito ay napakahirap - pag-ubos at mahal na oras."

Hindi ito sinasabi na hindi nakukuha ng mga hayop ang kanilang mga genome. Ang Proyekto ng Genome 10K ay naglalayong kolektahin ang kaban ng genetiko ng Noah. At ang timog puting rhino, isang mas maraming tao at mas malaking species, ay nagkaroon ng genome sequenced nito sa 2012. Ngunit paano ang tungkol sa itim na rhino tulad ng Ntombi? "Hindi malinaw kung bakit ang mga itim na rhinoceros ay naiwan sa panig ng mahaba," sabi ni Markus. Siya ay nagsisisi ng pagkawala hanggang sa happenstance; ngunit maaaring ito ay, dahil ang southern whites ay na-sequenced, ang black rhino ay hindi naging isang priority.

Nilayon ni Markus, Murray, at kanilang mga tagatulong na i-plug ang puwang na iyon. Ang Ntombi, ang poster rhino para sa proyektong ito, ay nagkaroon ng dugo na inilabas at napanatili - at, bingo! Rhino DNA. Ang sequencing ay dapat na medyo tapat, sinabi Murray. "Napakalaking tulong na magkaroon ng puting rhino genome bilang benchmark."

Ang mga susunod na hakbang sa pagkakasunud-sunod

Sa DNA ng Ntombi na naka-host sa mga server ng DNAnexsus, ang mga biologist ay maglagay ng pundasyon para sa paghahambing ng rhino genomics. "Sa sandaling makuha namin ang kanyang pagkakasunud-sunod maaari naming simulan upang maunawaan kung ano ang gumagawa ng isang rhino isang rhino, kung paano ang puti ay naiiba mula sa itim," sabi ni Murray, "at magbigay ng impormasyon na makakatulong sa subaybayan ang mga sample na nakuha."

Maaaring suriin ng mga beterinaryo ang posibleng mga genes na nagdudulot ng sakit, at may baseline na ihambing ang iba pang pitong black rhino subspecies - tatlo sa mga ito ay wala na.

Ang mga hayop pagkatapos bukas

Sa sandaling mayroon kaming isang mas matatag na pag-unawa sa itim na rhinoceros genetics, maraming mga pintor na panteorya ang nakabukas. "Sa kalsada ako ay nasasabik tungkol sa paggamit ng mga cell stem upang maunawaan ang rhino physiology at, potensyal na, upang palaguin ang mga sungay ng rhino sa lab upang mabawasan ang paglulusob," sabi ni Murray.

Markus prognosticates ng kaunti pa. Para sa diceros bicornis bicornis, Hindi nakikita ni Markus ang napakaraming mammoth-style na de-pagkalipol ngunit pinalitan ang genetic clock; ang mas maliliit na populasyon ay nakakakuha, mas madaling kapitan ang mga ito sa mga minanang problema.

At para sa mga itim na rhino na nawala? Inihahambing niya ang pagsisikap na ito sa pagkakasunud-sunod ng hilagang puting rhino genome, isang proyektong nagpapatuloy sa San Diego Zoo. May pinag-uusapan ng sinusubukan na makakuha ng isang southern white rhino (kung saan may 20,000) upang magdala ng isang hilagang puting rhino (kung saan may 5) sa term. Nagsasalita si Markus nang maingat, maingat na pag-asa: "May potensyal na - potensyal - marahil ang patay na rhino subspecies na maaaring patayin muli."

$config[ads_kvadrat] not found